Спустя совсем немного времени Антоний вместе с еще одним монахом отправился в Марокко, чтобы проповедовать и умереть во имя Христа. Едва он прибыл на место, как его одолел жар и недуг, из-за чего он провел несколько недель в полусознательном состоянии. Он не мог даже стоять, не то что проповедовать Слово Божие на рыночной площади. Его мечта нести Свет Христа была разрушена. Все, что ему оставалось – отдаться на волю Господа. Антоний попрощался с Африкой и вернулся в Португалию. Но даже этот выбор стал очередным испытанием для Антония. Корабль, на котором он плыл, попал в жуткий шторм и сбился с пути. В конце концов, он вынужден был причалить у берегов Сицилии. Слабый и сбитый с толку, не понимая, чего хочет от него Бог, Антоний направился в Ассизи, где вот-вот должен был состояться Генеральный капитул францисканцев. В праздник Пятидесятницы 1221 года тысячи монахов собрались в Ассизи со всей Европы. Позднее это собрание получило название Капитула рогожек.
Там Антоний услышал учение Святого Франциска, и это его утешило. Когда монахи начали разъезжаться по своим обителям, Антоний ждал указания, куда же направиться ему. В конце концов, Архиепископ Болоньи, отец Грациано, пригласил Антония последовать с ним. Грациано отправил Антония в небольшую обитель, расположенную на холмах городка Монтепаоло, недалеко от Форли, чтобы служить священником для братьев-отшельников, проживавших там.